تبدأ قصة الفيلم بعد عامين من أحداث المسلسل… Edward Elric يعيش في ميونيخ في ألمانيا عام 1923 ، بعد أحداث الحرب العالمية الأولى مباشرة و قبل الحرب العالمية الثانية. تجرد إدوارد من قدرته على إستخدام الكيمياء، و هو الآن مع صديقه Alphonse Heiderich يقوم بدراسة الصواريخ فقد تكون وسيلته في عبور البوابة و العودة إلى عالمه. في الوقت ذاته و في الجانب الآخر من البوابة، Alphonse Elric يعمل جاهداً لإيجاد طريقة لإعادة إدوارد